MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 81968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013851	GC	4	8	44249	44256	0 %	0 %	50 %	50 %	288939802
1002	NC_013851	CGC	2	6	44308	44313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939802
1003	NC_013851	CT	3	6	44318	44323	0 %	50 %	0 %	50 %	288939802
1004	NC_013851	CAG	2	6	44357	44362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939802
1005	NC_013851	CGA	2	6	44365	44370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939802
1006	NC_013851	CG	3	6	44376	44381	0 %	0 %	50 %	50 %	288939802
1007	NC_013851	CGG	2	6	44400	44405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939802
1008	NC_013851	GACC	2	8	44440	44447	25 %	0 %	25 %	50 %	288939802
1009	NC_013851	GC	3	6	44454	44459	0 %	0 %	50 %	50 %	288939802
1010	NC_013851	ACA	2	6	44511	44516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288939802
1011	NC_013851	CGC	2	6	44566	44571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_013851	TCCAC	2	10	44650	44659	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1013	NC_013851	CAGA	2	8	44699	44706	50 %	0 %	25 %	25 %	288939803
1014	NC_013851	ATC	2	6	44745	44750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939803
1015	NC_013851	GCTG	2	8	44806	44813	0 %	25 %	50 %	25 %	288939803
1016	NC_013851	TGG	2	6	44827	44832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939803
1017	NC_013851	CTTG	2	8	44975	44982	0 %	50 %	25 %	25 %	288939803
1018	NC_013851	GA	3	6	45052	45057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_013851	CTT	2	6	45068	45073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939804
1020	NC_013851	TTC	2	6	45256	45261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939804
1021	NC_013851	TCG	2	6	45314	45319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939804
1022	NC_013851	TCG	2	6	45326	45331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939804
1023	NC_013851	TCG	2	6	45335	45340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939804
1024	NC_013851	C	6	6	45386	45391	0 %	0 %	0 %	100 %	288939804
1025	NC_013851	TCT	2	6	45404	45409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939804
1026	NC_013851	TGA	2	6	45422	45427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939804
1027	NC_013851	ACC	2	6	45532	45537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939804
1028	NC_013851	CTG	2	6	45577	45582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939804
1029	NC_013851	CTA	2	6	45588	45593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939804
1030	NC_013851	CGG	2	6	45615	45620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939804
1031	NC_013851	TCGC	2	8	45715	45722	0 %	25 %	25 %	50 %	288939804
1032	NC_013851	GAT	2	6	45756	45761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939804
1033	NC_013851	GCT	2	6	45777	45782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939804
1034	NC_013851	CGG	3	9	45786	45794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939804
1035	NC_013851	CCG	2	6	45812	45817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939804
1036	NC_013851	TGC	2	6	45821	45826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939804
1037	NC_013851	ATC	2	6	45856	45861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939804
1038	NC_013851	CTTCAT	2	12	45873	45884	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	288939804
1039	NC_013851	GCC	2	6	45953	45958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_013851	CAAC	2	8	45987	45994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_013851	T	6	6	46003	46008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013851	TGC	2	6	46188	46193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939805
1043	NC_013851	TTC	2	6	46202	46207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939805
1044	NC_013851	TCCGGC	2	12	46290	46301	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_013851	GAT	2	6	46393	46398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939806
1046	NC_013851	TCG	2	6	46413	46418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939806
1047	NC_013851	GCC	2	6	46441	46446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939806
1048	NC_013851	CGC	3	9	46495	46503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939806
1049	NC_013851	AGC	2	6	46536	46541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939806
1050	NC_013851	GC	4	8	46540	46547	0 %	0 %	50 %	50 %	288939806
1051	NC_013851	TGA	2	6	46554	46559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939806
1052	NC_013851	AGG	2	6	46560	46565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939806
1053	NC_013851	TCG	2	6	46587	46592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939806
1054	NC_013851	CGAC	2	8	46611	46618	25 %	0 %	25 %	50 %	288939806
1055	NC_013851	TCG	2	6	46620	46625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939806
1056	NC_013851	CG	3	6	46642	46647	0 %	0 %	50 %	50 %	288939806
1057	NC_013851	GCC	3	9	46670	46678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939806
1058	NC_013851	CG	5	10	46706	46715	0 %	0 %	50 %	50 %	288939806
1059	NC_013851	CGC	3	9	46750	46758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939806
1060	NC_013851	TCC	2	6	46767	46772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939806
1061	NC_013851	TCG	2	6	46806	46811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939806
1062	NC_013851	AGC	2	6	46824	46829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939806
1063	NC_013851	CAC	2	6	46858	46863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939807
1064	NC_013851	CG	3	6	46867	46872	0 %	0 %	50 %	50 %	288939807
1065	NC_013851	GCC	2	6	46886	46891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939807
1066	NC_013851	GCT	2	6	46945	46950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939807
1067	NC_013851	CG	3	6	47007	47012	0 %	0 %	50 %	50 %	288939807
1068	NC_013851	CTG	2	6	47027	47032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939807
1069	NC_013851	GGC	2	6	47056	47061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939807
1070	NC_013851	CG	3	6	47098	47103	0 %	0 %	50 %	50 %	288939807
1071	NC_013851	CG	3	6	47125	47130	0 %	0 %	50 %	50 %	288939807
1072	NC_013851	GAG	2	6	47138	47143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939807
1073	NC_013851	CGTCG	2	10	47144	47153	0 %	20 %	40 %	40 %	288939807
1074	NC_013851	GCGT	2	8	47163	47170	0 %	25 %	50 %	25 %	288939807
1075	NC_013851	TCGAAG	2	12	47193	47204	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	288939807
1076	NC_013851	CGG	2	6	47293	47298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939807
1077	NC_013851	ATCC	2	8	47407	47414	25 %	25 %	0 %	50 %	288939808
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1081	NC_013851	CTG	2	6	47703	47708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939808
1082	NC_013851	CGT	2	6	47714	47719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939808
1083	NC_013851	GTCG	2	8	47816	47823	0 %	25 %	50 %	25 %	288939808
1084	NC_013851	CGGT	2	8	47869	47876	0 %	25 %	50 %	25 %	288939808
1085	NC_013851	ATC	2	6	47895	47900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939808
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1088	NC_013851	CTC	2	6	48002	48007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939808
1089	NC_013851	CGC	2	6	48011	48016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939808
1090	NC_013851	CAT	2	6	48059	48064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939808
1091	NC_013851	CGC	2	6	48068	48073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939808
1092	NC_013851	CGC	2	6	48077	48082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939808
1093	NC_013851	CCG	2	6	48088	48093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939808
1094	NC_013851	GAC	2	6	48177	48182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939808
1095	NC_013851	GCT	3	9	48218	48226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939808
1096	NC_013851	CGT	2	6	48228	48233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939808
1097	NC_013851	CCG	2	6	48234	48239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939808
1098	NC_013851	TCT	2	6	48265	48270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939808
1099	NC_013851	GC	3	6	48293	48298	0 %	0 %	50 %	50 %	288939808
1100	NC_013851	CG	4	8	48299	48306	0 %	0 %	50 %	50 %	288939808
1101	NC_013851	CAT	2	6	48380	48385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939808
1102	NC_013851	GACC	2	8	48464	48471	25 %	0 %	25 %	50 %	288939808
1103	NC_013851	TCCG	2	8	48487	48494	0 %	25 %	25 %	50 %	288939808
1104	NC_013851	GGT	2	6	48528	48533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939808
1105	NC_013851	ATC	2	6	48549	48554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939808
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1107	NC_013851	CGG	3	9	48563	48571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939808
1108	NC_013851	GGC	2	6	48605	48610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939808
1109	NC_013851	AGC	2	6	48652	48657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939808
1110	NC_013851	GCG	2	6	48664	48669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939808
1111	NC_013851	CGA	2	6	48764	48769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939808
1112	NC_013851	AAG	2	6	48780	48785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939808
1113	NC_013851	GTC	2	6	48786	48791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939808
1114	NC_013851	CCGC	2	8	48826	48833	0 %	0 %	25 %	75 %	288939808
1115	NC_013851	ACG	2	6	48874	48879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939808
1116	NC_013851	CGC	2	6	48899	48904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939808
1117	NC_013851	CAA	2	6	48923	48928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288939808
1118	NC_013851	GCC	2	6	48942	48947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_013851	GCC	2	6	48956	48961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_013851	CCT	2	6	48964	48969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_013851	CGG	2	6	48979	48984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_013851	GTG	2	6	48991	48996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013851	CCT	2	6	49016	49021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_013851	ACC	2	6	49024	49029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_013851	CGGC	2	8	49037	49044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_013851	AGA	2	6	49127	49132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939809
1127	NC_013851	GCC	2	6	49192	49197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939809
1128	NC_013851	TCA	2	6	49229	49234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939809
1129	NC_013851	ACGCC	2	10	49247	49256	20 %	0 %	20 %	60 %	288939809
1130	NC_013851	TCG	2	6	49313	49318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939809
1131	NC_013851	GCG	2	6	49340	49345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939809
1132	NC_013851	CCG	2	6	49365	49370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939809
1133	NC_013851	CGC	2	6	49398	49403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939809
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1136	NC_013851	CGG	2	6	49464	49469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939809
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1138	NC_013851	GCC	2	6	49819	49824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939809
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1140	NC_013851	GCC	2	6	49885	49890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939809
1141	NC_013851	GCG	2	6	49919	49924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939809
1142	NC_013851	CCG	3	9	49925	49933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939809
1143	NC_013851	ACCG	2	8	49938	49945	25 %	0 %	25 %	50 %	288939809
1144	NC_013851	GCCG	2	8	49946	49953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1145	NC_013851	CG	3	6	49952	49957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1146	NC_013851	CGGG	2	8	49976	49983	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1147	NC_013851	GTG	2	6	50056	50061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939810
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1149	NC_013851	GTG	2	6	50077	50082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939810
1150	NC_013851	CG	3	6	50096	50101	0 %	0 %	50 %	50 %	288939810
1151	NC_013851	ATG	2	6	50120	50125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939810
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1154	NC_013851	CGAC	2	8	50210	50217	25 %	0 %	25 %	50 %	288939810
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1157	NC_013851	CGGT	2	8	50270	50277	0 %	25 %	50 %	25 %	288939810
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1161	NC_013851	GCC	2	6	50395	50400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939810
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1190	NC_013851	GCG	2	6	51735	51740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939811
1191	NC_013851	TGA	2	6	51919	51924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1192	NC_013851	GGC	2	6	51980	51985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939812
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1225	NC_013851	GCTCAC	2	12	53255	53266	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288939812
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1234	NC_013851	CA	3	6	53629	53634	50 %	0 %	0 %	50 %	288939813
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1236	NC_013851	CAT	2	6	53718	53723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939813
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1238	NC_013851	CCAT	2	8	53810	53817	25 %	25 %	0 %	50 %	288939813
1239	NC_013851	GC	3	6	53856	53861	0 %	0 %	50 %	50 %	288939813
1240	NC_013851	GCG	2	6	53908	53913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939813
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1242	NC_013851	GCT	2	6	54006	54011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939813
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1245	NC_013851	AGC	2	6	54194	54199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939813
1246	NC_013851	CG	3	6	54200	54205	0 %	0 %	50 %	50 %	288939813
1247	NC_013851	TCG	2	6	54311	54316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939813
1248	NC_013851	TGG	2	6	54344	54349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939813
1249	NC_013851	TGGA	2	8	54358	54365	25 %	25 %	50 %	0 %	288939813
1250	NC_013851	GCGA	2	8	54400	54407	25 %	0 %	50 %	25 %	288939813
1251	NC_013851	TATCGC	2	12	54409	54420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288939813
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1253	NC_013851	CCG	2	6	54476	54481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939813
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1362	NC_013851	TCCTGG	2	12	60361	60372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1373	NC_013851	CTGA	2	8	60881	60888	25 %	25 %	25 %	25 %	288939818
1374	NC_013851	CGT	2	6	60994	60999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939818
1375	NC_013851	CAG	2	6	61070	61075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939818
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